柴油发电机组超过10分钟的长时间低怠速或空载会损坏发动机。因为燃烧室温度太低以致于燃油不能完全燃烧。这将引起在喷油器喷孔以及活塞环周围形成积炭并引起气门粘连。如果发动机冷却液温度低于60°C，未燃烧的燃油将会冲刷掉气缸壁上的润滑油，并使曲轴箱的润滑油稀释。燃油的稀释物会影响润滑油的品质，并缩短发动机寿命，尽量缩短怠速时间以防止这种情况发生。
柴油发电机组在小负荷下运行，随着运行时间的延续，会出现以下5大危害：
1、柴油发电机组活塞—气缸套密封不好，机油上窜，进入燃烧室燃烧，排气冒蓝烟。
2、对于增压式柴油发电机组，由于低载、空载，增压压力低。容易导致增压器油封（非接触式）的密封效果下降，机油窜入增压室，随同进气进入气缸。
3、上窜至气缸的一部分机油参与燃烧，一部分机油不能完全燃烧，在气门、进气道、活塞顶、活塞环等处形成积炭，还有一部分则随排气排出。这样，气缸套排气道内就会逐步积聚机油，也会形成积炭。
4、柴油发电机组增压器的增压室内机油积聚到一定程度，就会从增压器的结合面处渗漏出。
5、柴油发电机组长期小负荷运行，将会更严重的导致运动部件磨损加剧，发动机燃烧环境恶化等导致大修期提前的后果。
因此，国外柴油机制造厂商无论对自然吸气型还是增压机型的使用都强调应尽量减少低载/空载运行时间，并规定小负荷不能低于机组额定功率的25%-30%。